 1997年，经过全所上下多次讨论，由本所徐世平副研究员设计的方案被选为我所的形象标识，最后确定以所徽的形式在多方面广泛使用。其含义如下：
一、外形 以各角略为钝化的正六边形为基本形状，表现科研单位严谨、求实的特点；六边形结构寓意矿物晶体和苯环，代表我所的矿物和有机地球化学，颜色上使用天蓝色与院徽颜色一脉相承，代表中科院下属机构，同时蓝色也代表天空、海洋和宇宙，寓意我所的研究对象和研究领域。
二、圆形 所徽中部为一绿色的圆形，加上金黄色的经纬线，代表地球形象，表达本所的地学特征，以绿色表达我所的基本使命是通过资源环境可持续发展研究为后代留下一个绿色的地球，大面积使用蓝色和绿色，强调蓝天、大海和绿地。
三、字母G：在绿色地球的周围镶以未封闭金色圆环，形成字母G的形状，在构图上增加了稳定感和向心感，字母G的收笔变化成锤子的形状，形成传统地质学象征符号。字母G具有多重含义，即重复地学（Geo-） 主题，也表示广州（Guangzhou）、金子(Gold)、团队(Group)和宝石(Gem)等，其寓意是全所团结协作、积极创造，我所像一颗金色明珠在中科院大家庭中熠熠生辉。
四、文字 以中科院前院长郭沫若先生的亲笔题字为中文所名（“广州”两字为摹仿笔迹），以表示对先生的尊敬和地化所在国内外的地位。将红色文字放在绿色背景上，给冷静、庄重的图案增加了活泼的气氛，暗示我所老一代科学家硕果累累，新一代科学家茁壮成长。为便于国际交流，所徽中加入了所名的英文缩写，同时也是图形的对称元素。 |
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